Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGEA3P43357 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGEA3P43357 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms