Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTGER2P43116 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTGER2P43116 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTGER2P43116 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms