Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX1P40424 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX1P40424 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX1P40424 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX1P40424 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX1P40424 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX1P40424 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX1P40424 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX1P40424 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX1P40424 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX1P40424 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX1P40424 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX1P40424 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX1P40424 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX1P40424 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX1P40424 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX1P40424 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX1P40424 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX1P40424 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX1P40424 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX1P40424 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX1P40424 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX1P40424 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX1P40424 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX1P40424 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX1P40424 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX1P40424 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX1P40424 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX1P40424 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX1P40424 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX1P40424 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX1P40424 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX1P40424 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms