Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 HXT14YNL318C 1623 nt5.3□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 OCA5YHL029C 2040 nt5.3□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 CDS1YBR029C 1374 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 MCM4YPR019W 2802 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 APC4YDR118W 1959 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 URA7YBL039C 1740 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 GIP1YBR045C 1920 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 YGP1YNL160W 1065 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 YNL194CYNL194C 906 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 CIN5YOR028C 888 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 KRS1YDR037W 1776 nt5.29□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 SLZ1YNL196C 897 nt5.28□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 MDY2YOL111C 639 nt5.28□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 TRS33YOR115C 807 nt5.28□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 ICY2YPL250C 411 nt5.28□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 MSC7YHR039C 1935 nt5.28□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 BUD22YMR014W 1560 nt5.28□□□□□ -1.56
YBL028CP38202 AZR1YGR224W 1842 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SSY5YJL156C 2100 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 ROT2YBR229C 2865 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SLT2YHR030C 1455 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 GWT1YJL091C 1473 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 PRP40YKL012W 1752 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 DPH6YLR143W 2058 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YER084WYER084W 387 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YKL223WYKL223W 333 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 NMD4YLR363C 657 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YPL278CYPL278C 303 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 FZO1YBR179C 2568 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 STB3YDR169C 1542 nt5.27□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SIP5YMR140W 1470 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SSH4YKL124W 1740 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YDL012CYDL012C 324 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YDR417CYDR417C 372 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 ECT1YGR007W 972 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YGR153WYGR153W 654 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 TYS1YGR185C 1185 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 UBI4YLL039C 1146 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YNL228WYNL228W 777 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YNG1YOR064C 660 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 GRE1YPL223C 507 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SDA1YGR245C 2304 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 ATG1YGL180W 2694 nt5.26□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SYP1YCR030C 2613 nt5.25□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SCP1YOR367W 603 nt5.25□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 ELC1YPL046C 300 nt5.25□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YGR122WYGR122W 1209 nt5.24□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SKI6YGR195W 741 nt5.24□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 RPL15BYMR121C 615 nt5.24□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 TUB3YML124C 1338 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 GCN20YFR009W 2259 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 GUS1YGL245W 2127 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 GAL4YPL248C 2646 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 RSM10YDR041W 612 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YGL088WYGL088W 366 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 RFC2YJR068W 1062 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 MED4YOR174W 855 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 RSC6YCR052W 1452 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 LYP1YNL268W 1836 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 BIT2YBR270C 1638 nt5.23□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SIA1YOR137C 1869 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 CBF5YLR175W 1452 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YMR196WYMR196W 3267 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 PRP43YGL120C 2304 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 RAD57YDR004W 1383 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YHR095WYHR095W 495 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 RRN9YMR270C 1098 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 YNL181WYNL181W 1224 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 SPN1YPR133C 1233 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 GPR1YDL035C 2886 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 PTR2YKR093W 1806 nt5.22□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 RTC1YOL138C 4026 nt5.21□□□□□ -1.57
YBL028CP38202 PRO2YOR323C 1371 nt5.21□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 CPS1YJL172W 1731 nt5.21□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 SUP35YDR172W 2058 nt5.21□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 FAA3YIL009W 2085 nt5.21□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 EAF5YEL018W 840 nt5.21□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 GIP2YER054C 1647 nt5.21□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 KAR2YJL034W 2049 nt5.21□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 FRT2YAL028W 1587 nt5.21□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 RXT3YDL076C 885 nt5.2□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 ASP1YDR321W 1146 nt5.2□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.2□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 QCR2YPR191W 1107 nt5.2□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 UBX7YBR273C 1311 nt5.2□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 GCR2YNL199C 1605 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 RFU1YLR073C 603 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 HEM15YOR176W 1182 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 IMD3YLR432W 1572 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 ALG6YOR002W 1635 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 FRE1YLR214W 2061 nt5.19□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 PRT1YOR361C 2292 nt5.18□□□□□ -1.58
YBL028CP38202 RFT1YBL020W 1725 nt5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms