Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP62P37198 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP62P37198 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP62P37198 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP62P37198 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUP62P37198 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUP62P37198 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP62P37198 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP62P37198 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP62P37198 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.8 ms