Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L1P36222 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms