Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA5AP35218 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA5AP35218 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA5AP35218 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA5AP35218 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA5AP35218 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA5AP35218 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA5AP35218 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA5AP35218 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA5AP35218 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA5AP35218 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA5AP35218 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA5AP35218 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CA5AP35218 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CA5AP35218 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA5AP35218 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA5AP35218 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA5AP35218 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA5AP35218 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA5AP35218 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA5AP35218 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA5AP35218 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA5AP35218 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA5AP35218 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA5AP35218 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CA5AP35218 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CA5AP35218 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA5AP35218 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA5AP35218 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA5AP35218 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA5AP35218 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms