Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD11P31277 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD11P31277 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms