Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA13P31271 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA13P31271 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA13P31271 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms