Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRIP30626 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRIP30626 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRIP30626 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRIP30626 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRIP30626 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRIP30626 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRIP30626 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRIP30626 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRIP30626 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRIP30626 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRIP30626 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SRIP30626 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRIP30626 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRIP30626 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRIP30626 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms