Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLIP1P30622 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLIP1P30622 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CLIP1P30622 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CLIP1P30622 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms