Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms