Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMLP26374 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMLP26374 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMLP26374 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMLP26374 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMLP26374 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMLP26374 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMLP26374 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMLP26374 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMLP26374 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMLP26374 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMLP26374 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMLP26374 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMLP26374 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMLP26374 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHMLP26374 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMLP26374 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMLP26374 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMLP26374 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMLP26374 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMLP26374 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMLP26374 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMLP26374 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMLP26374 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMLP26374 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHMLP26374 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMLP26374 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMLP26374 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMLP26374 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMLP26374 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHMLP26374 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMLP26374 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMLP26374 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMLP26374 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMLP26374 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMLP26374 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMLP26374 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMLP26374 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHMLP26374 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMLP26374 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CHMLP26374 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHMLP26374 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHMLP26374 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHMLP26374 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHMLP26374 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHMLP26374 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMLP26374 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMLP26374 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMLP26374 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMLP26374 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMLP26374 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMLP26374 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMLP26374 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMLP26374 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMLP26374 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMLP26374 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms