Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMO1P25800 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMO1P25800 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMO1P25800 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMO1P25800 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LMO1P25800 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMO1P25800 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMO1P25800 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO1P25800 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO1P25800 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO1P25800 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO1P25800 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO1P25800 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO1P25800 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO1P25800 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMO1P25800 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMO1P25800 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMO1P25800 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMO1P25800 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO1P25800 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMO1P25800 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO1P25800 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO1P25800 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO1P25800 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO1P25800 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO1P25800 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMO1P25800 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms