Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSMA4P25789 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA4P25789 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA4P25789 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms