Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMA3P25788 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA3P25788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms