Protein–RNA interactions for Protein: P20424

SRP54, Signal recognition particle subunit SRP54, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP54P20424 SKG1YKR100C 1068 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 APS1YLR170C 471 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 YML131WYML131W 1098 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 YET2YMR040W 483 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 YOL035CYOL035C 303 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 MET31YPL038W 534 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 TGS1YPL157W 948 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 GRE1YPL223C 507 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 snR34snR34 203 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 MOT2YER068W 1764 nt5.47□□□□□ -1.53
SRP54P20424 SEC9YGR009C 1956 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 HXT14YNL318C 1623 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 IMG2YCR071C 441 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 CAB1YDR531W 1104 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 AUA1YFL010W-A 285 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YMR114CYMR114C 1107 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 SPC24YMR117C 642 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YPL191CYPL191C 1083 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 snR19snR19 568 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 TUB3YML124C 1338 nt5.46□□□□□ -1.54
SRP54P20424 PGM2YMR105C 1710 nt5.45□□□□□ -1.54
SRP54P20424 CRT10YOL063C 2874 nt5.45□□□□□ -1.54
SRP54P20424 ATM1YMR301C 2073 nt5.45□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YMR245WYMR245W 621 nt5.45□□□□□ -1.54
SRP54P20424 ARG8YOL140W 1272 nt5.45□□□□□ -1.54
SRP54P20424 ATG32YIL146C 1590 nt5.45□□□□□ -1.54
SRP54P20424 ARN2YHL047C 1863 nt5.45□□□□□ -1.54
SRP54P20424 CTS2YDR371W 1536 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YDL027CYDL027C 1263 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 AXL2YIL140W 2472 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YKR073CYKR073C 321 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 MRPL39YML009C 213 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 DOM34YNL001W 1161 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YNL174WYNL174W 573 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 TLG2YOL018C 1194 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 ZPS1YOL154W 750 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 snR17bsnR17b 332 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YJR124CYJR124C 1347 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 DDC1YPL194W 1839 nt5.44□□□□□ -1.54
SRP54P20424 VTH1YIL173W 4650 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 VTH2YJL222W 4650 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 FAP1YNL023C 2898 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 MSC7YHR039C 1935 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 MKC7YDR144C 1791 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 snR57snR57 88 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 SLC1YDL052C 912 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YGL072CYGL072C 360 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YGR066CYGR066C 879 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YHL049CYHL049C 816 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 TRM10YOL093W 882 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YPL014WYPL014W 1146 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YPL199CYPL199C 723 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 FOB1YDR110W 1701 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YJL206CYJL206C 2277 nt5.43□□□□□ -1.54
SRP54P20424 PCA1YBR295W 3651 nt5.42□□□□□ -1.54
SRP54P20424 MSA2YKR077W 1092 nt5.42□□□□□ -1.54
SRP54P20424 NHP6AYPR052C 282 nt5.42□□□□□ -1.54
SRP54P20424 AFT1YGL071W 2073 nt5.42□□□□□ -1.54
SRP54P20424 FAA3YIL009W 2085 nt5.42□□□□□ -1.54
SRP54P20424 DHH1YDL160C 1521 nt5.42□□□□□ -1.54
SRP54P20424 RBA50YDR527W 1320 nt5.42□□□□□ -1.54
SRP54P20424 ROT2YBR229C 2865 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 URA7YBL039C 1740 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 AIR2YDL175C 1035 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YEL074WYEL074W 339 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 PCT1YGR202C 1275 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YLF2YHL014C 1218 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 CTR2YHR175W 570 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YJL220WYJL220W 453 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YLL017WYLL017W 312 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 VTA1YLR181C 993 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 FES1YBR101C 873 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 VHC1YBR235W 3363 nt5.41□□□□□ -1.54
SRP54P20424 MHF2YDL160C-A 243 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 TFB3YDR460W 966 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 HSP31YDR533C 714 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 RMR1YGL250W 726 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 TRX2YGR209C 315 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 SEC17YBL050W 879 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 COG5YNL051W 1212 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 RCL1YOL010W 1104 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 YPL113CYPL113C 1191 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 CDC28YBR160W 897 nt5.4□□□□□ -1.54
SRP54P20424 VMS1YDR049W 1899 nt5.4□□□□□ -1.55
SRP54P20424 RSC6YCR052W 1452 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 GMC1YDR506C 1827 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 HOT1YMR172W 2160 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 BUD7YOR299W 2241 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 PCL9YDL179W 915 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YDR417CYDR417C 372 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 SCS2YER120W 735 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 RPP0YLR340W 939 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 OSW5YMR148W 447 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YGP1YNL160W 1065 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 SFT2YBL102W 648 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 NDJ1YOL104C 1059 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 YMR102CYMR102C 2505 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.39□□□□□ -1.55
SRP54P20424 PRM1YNL279W 1986 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms