Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TRHP20396 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRHP20396 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRHP20396 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TRHP20396 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRHP20396 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRHP20396 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRHP20396 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
TRHP20396 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRHP20396 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRHP20396 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRHP20396 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TRHP20396 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRHP20396 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRHP20396 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRHP20396 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
TRHP20396 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRHP20396 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRHP20396 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRHP20396 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TRHP20396 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TRHP20396 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRHP20396 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRHP20396 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRHP20396 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TRHP20396 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TRHP20396 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRHP20396 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRHP20396 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRHP20396 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TRHP20396 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRHP20396 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRHP20396 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRHP20396 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRHP20396 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRHP20396 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRHP20396 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRHP20396 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
TRHP20396 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
TRHP20396 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRHP20396 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRHP20396 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TRHP20396 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRHP20396 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TRHP20396 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRHP20396 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRHP20396 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRHP20396 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRHP20396 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRHP20396 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRHP20396 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRHP20396 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRHP20396 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRHP20396 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRHP20396 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRHP20396 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRHP20396 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
TRHP20396 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRHP20396 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRHP20396 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRHP20396 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRHP20396 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRHP20396 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRHP20396 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRHP20396 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRHP20396 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRHP20396 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRHP20396 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRHP20396 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRHP20396 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRHP20396 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TRHP20396 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRHP20396 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRHP20396 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRHP20396 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRHP20396 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRHP20396 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRHP20396 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRHP20396 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRHP20396 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRHP20396 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRHP20396 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRHP20396 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRHP20396 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRHP20396 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRHP20396 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRHP20396 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRHP20396 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRHP20396 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRHP20396 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms