Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB3AP20336 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms