Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH2P19022 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH2P19022 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH2P19022 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH2P19022 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH2P19022 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH2P19022 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH2P19022 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH2P19022 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH2P19022 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH2P19022 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH2P19022 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH2P19022 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH2P19022 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH2P19022 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH2P19022 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH2P19022 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDH2P19022 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH2P19022 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH2P19022 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH2P19022 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH2P19022 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH2P19022 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms