Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF6P18850 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF6P18850 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF6P18850 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF6P18850 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF6P18850 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF6P18850 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF6P18850 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF6P18850 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF6P18850 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF6P18850 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF6P18850 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF6P18850 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATF6P18850 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6P18850 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6P18850 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6P18850 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6P18850 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6P18850 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6P18850 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATF6P18850 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATF6P18850 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6P18850 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6P18850 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6P18850 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6P18850 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATF6P18850 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6P18850 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6P18850 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6P18850 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6P18850 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6P18850 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6P18850 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATF6P18850 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATF6P18850 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6P18850 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6P18850 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6P18850 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6P18850 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6P18850 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6P18850 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATF6P18850 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF6P18850 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF6P18850 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATF6P18850 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms