Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPD1P17405 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPD1P17405 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMPD1P17405 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms