Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GOT1P17174 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GOT1P17174 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOT1P17174 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOT1P17174 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOT1P17174 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOT1P17174 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOT1P17174 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOT1P17174 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GOT1P17174 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOT1P17174 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOT1P17174 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOT1P17174 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOT1P17174 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOT1P17174 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOT1P17174 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOT1P17174 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOT1P17174 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOT1P17174 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOT1P17174 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOT1P17174 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOT1P17174 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOT1P17174 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOT1P17174 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOT1P17174 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOT1P17174 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOT1P17174 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOT1P17174 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOT1P17174 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOT1P17174 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOT1P17174 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOT1P17174 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOT1P17174 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOT1P17174 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GOT1P17174 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOT1P17174 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOT1P17174 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOT1P17174 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms