Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2A2P16615 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2A2P16615 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2A2P16615 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms