Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB42P16452 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB42P16452 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB42P16452 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB42P16452 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB42P16452 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB42P16452 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPB42P16452 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB42P16452 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB42P16452 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPB42P16452 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPB42P16452 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB42P16452 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB42P16452 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB42P16452 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB42P16452 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB42P16452 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB42P16452 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPB42P16452 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPB42P16452 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPB42P16452 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPB42P16452 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms