Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPCAMP16422 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPCAMP16422 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPCAMP16422 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms