Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB2P14652 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB2P14652 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms