Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT13P13646 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT13P13646 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT13P13646 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT13P13646 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT13P13646 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT13P13646 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT13P13646 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT13P13646 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT13P13646 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT13P13646 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT13P13646 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT13P13646 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT13P13646 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT13P13646 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT13P13646 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT13P13646 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT13P13646 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT13P13646 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT13P13646 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT13P13646 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT13P13646 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT13P13646 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT13P13646 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT13P13646 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT13P13646 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT13P13646 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT13P13646 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT13P13646 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT13P13646 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT13P13646 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT13P13646 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT13P13646 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms