Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH1P12830 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH1P12830 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH1P12830 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH1P12830 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH1P12830 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH1P12830 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH1P12830 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH1P12830 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH1P12830 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH1P12830 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH1P12830 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH1P12830 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH1P12830 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH1P12830 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH1P12830 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH1P12830 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH1P12830 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH1P12830 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH1P12830 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH1P12830 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH1P12830 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH1P12830 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH1P12830 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH1P12830 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH1P12830 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH1P12830 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH1P12830 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH1P12830 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH1P12830 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH1P12830 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH1P12830 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH1P12830 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH1P12830 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH1P12830 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH1P12830 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH1P12830 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms