Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODC1P11926 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODC1P11926 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODC1P11926 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODC1P11926 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ODC1P11926 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ODC1P11926 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODC1P11926 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ODC1P11926 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODC1P11926 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODC1P11926 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODC1P11926 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODC1P11926 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODC1P11926 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODC1P11926 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODC1P11926 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODC1P11926 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODC1P11926 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODC1P11926 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODC1P11926 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODC1P11926 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODC1P11926 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODC1P11926 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODC1P11926 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODC1P11926 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODC1P11926 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODC1P11926 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODC1P11926 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODC1P11926 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODC1P11926 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODC1P11926 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODC1P11926 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODC1P11926 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ODC1P11926 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ODC1P11926 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODC1P11926 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODC1P11926 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ODC1P11926 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODC1P11926 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODC1P11926 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODC1P11926 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODC1P11926 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODC1P11926 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODC1P11926 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODC1P11926 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODC1P11926 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODC1P11926 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODC1P11926 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODC1P11926 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ODC1P11926 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODC1P11926 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODC1P11926 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms