Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBP3P10745 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBP3P10745 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBP3P10745 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBP3P10745 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBP3P10745 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBP3P10745 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBP3P10745 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP3P10745 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP3P10745 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP3P10745 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP3P10745 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP3P10745 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP3P10745 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP3P10745 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP3P10745 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP3P10745 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP3P10745 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBP3P10745 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP3P10745 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP3P10745 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBP3P10745 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms