Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMIGD3P0DMS9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD3P0DMS9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD3P0DMS9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms