Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C8orf88P0DMB2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf88P0DMB2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms