Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2P0DI81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2P0DI81 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms