Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM200BP0CF97 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM200BP0CF97 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms