Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM228BP0C875 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM228BP0C875 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms