Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CT47B1P0C2W7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CT47B1P0C2W7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CT47B1P0C2W7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms