Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXB7P09629 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXB7P09629 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXB7P09629 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms