Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDGFRBP09619 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRBP09619 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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