Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MMP10P09238 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MMP10P09238 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MMP10P09238 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP10P09238 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP10P09238 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP10P09238 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP10P09238 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP10P09238 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP10P09238 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP10P09238 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP10P09238 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP10P09238 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP10P09238 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP10P09238 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP10P09238 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP10P09238 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP10P09238 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP10P09238 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP10P09238 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP10P09238 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP10P09238 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP10P09238 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP10P09238 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MMP10P09238 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP10P09238 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP10P09238 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP10P09238 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP10P09238 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MMP10P09238 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP10P09238 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP10P09238 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP10P09238 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP10P09238 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP10P09238 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MMP10P09238 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.3 ms