Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOP08100 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOP08100 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHOP08100 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHOP08100 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOP08100 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOP08100 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOP08100 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOP08100 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOP08100 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOP08100 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOP08100 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOP08100 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOP08100 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOP08100 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOP08100 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOP08100 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOP08100 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOP08100 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOP08100 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOP08100 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOP08100 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOP08100 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms