Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LYNP07948 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LYNP07948 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNP07948 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNP07948 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNP07948 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNP07948 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNP07948 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNP07948 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LYNP07948 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LYNP07948 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LYNP07948 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYNP07948 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LYNP07948 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LYNP07948 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNP07948 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNP07948 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNP07948 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNP07948 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNP07948 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNP07948 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LYNP07948 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNP07948 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNP07948 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNP07948 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNP07948 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNP07948 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LYNP07948 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYNP07948 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYNP07948 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNP07948 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNP07948 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNP07948 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYNP07948 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms