Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSLP07711 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSLP07711 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSLP07711 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSLP07711 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSLP07711 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSLP07711 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSLP07711 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSLP07711 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSLP07711 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSLP07711 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSLP07711 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSLP07711 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSLP07711 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSLP07711 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSLP07711 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSLP07711 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSLP07711 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSLP07711 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSLP07711 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSLP07711 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSLP07711 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSLP07711 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSLP07711 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSLP07711 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSLP07711 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSLP07711 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSLP07711 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSLP07711 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSLP07711 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSLP07711 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSLP07711 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSLP07711 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSLP07711 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSLP07711 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSLP07711 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSLP07711 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSLP07711 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSLP07711 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSLP07711 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSLP07711 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSLP07711 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSLP07711 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSLP07711 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSLP07711 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms