Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLK3P07288 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLK3P07288 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLK3P07288 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLK3P07288 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLK3P07288 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLK3P07288 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLK3P07288 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLK3P07288 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLK3P07288 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLK3P07288 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms