Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL1P05976 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL1P05976 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL1P05976 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL1P05976 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL1P05976 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYL1P05976 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYL1P05976 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYL1P05976 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYL1P05976 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL1P05976 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL1P05976 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL1P05976 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL1P05976 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL1P05976 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL1P05976 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYL1P05976 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL1P05976 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL1P05976 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL1P05976 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MYL1P05976 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYL1P05976 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL1P05976 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL1P05976 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL1P05976 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL1P05976 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL1P05976 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL1P05976 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL1P05976 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYL1P05976 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL1P05976 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL1P05976 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL1P05976 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL1P05976 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL1P05976 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL1P05976 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MYL1P05976 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL1P05976 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL1P05976 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL1P05976 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL1P05976 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL1P05976 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL1P05976 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYL1P05976 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL1P05976 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL1P05976 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL1P05976 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYL1P05976 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL1P05976 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL1P05976 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL1P05976 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL1P05976 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL1P05976 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYL1P05976 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYL1P05976 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYL1P05976 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYL1P05976 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms