Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCG5P05408 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCG5P05408 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCG5P05408 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCG5P05408 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCG5P05408 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCG5P05408 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCG5P05408 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCG5P05408 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCG5P05408 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCG5P05408 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCG5P05408 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCG5P05408 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCG5P05408 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCG5P05408 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCG5P05408 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCG5P05408 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SCG5P05408 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCG5P05408 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCG5P05408 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCG5P05408 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCG5P05408 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCG5P05408 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCG5P05408 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCG5P05408 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCG5P05408 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCG5P05408 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCG5P05408 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms