Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC3P02656 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC3P02656 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOC3P02656 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC3P02656 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC3P02656 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC3P02656 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC3P02656 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC3P02656 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC3P02656 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC3P02656 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOC3P02656 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOC3P02656 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOC3P02656 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOC3P02656 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms