Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POMCP01189 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMCP01189 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMCP01189 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMCP01189 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMCP01189 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMCP01189 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMCP01189 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMCP01189 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMCP01189 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POMCP01189 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POMCP01189 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMCP01189 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POMCP01189 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POMCP01189 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POMCP01189 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POMCP01189 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POMCP01189 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POMCP01189 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POMCP01189 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMCP01189 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMCP01189 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POMCP01189 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POMCP01189 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POMCP01189 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms