Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE6O95741 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE6O95741 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms