Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCB11O95342 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB11O95342 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB11O95342 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms